隨著聯盟的動作，原本風平浪靜的世界突然變得波動激盪起來，特別是整個地下世界，更是風起雲湧。
不過對於普通人來說，這些事基本上接觸不到，但是主角除外。
作為事件觸發器的小智最近非常辛苦。
自從碰到幼年的大木博士，一個叫做雪成的少年，小智便想著辦法要幫他，幫他找到雪拉比，幫他返回自己的時空。
然而反派的勢力空前的囂張，小智在果野村碰到了火箭隊高級幹部，比夏斯。
並且發現比夏斯也在搜尋雪拉比的位置，這下可不得了了，自詡正義使者的小智決定解決掉比夏斯。
在小智與比夏斯的第一次碰撞中，小智帶著小霞和雪成，憑藉著自己在森林裡的優秀潛伏經驗，偷襲了比夏斯。
比夏斯一個不慎，竟然真的被小智他們偷襲成功了，手上的黑暗球都被小智他們搶走了。
不過比夏斯到底是老江湖，手底下的精靈直接帶著比夏斯逃跑成功。
然而事件並沒有結束，比夏斯誤打誤撞逃到了果野村的位置，並且趁著小智他們外出，直接控制住了果野村的村民。
果野村的村民世代居住在森林裡，跟外界接觸極少，連個像樣的精靈訓練家都沒有，根本無法反抗比夏斯。
等到小智他們返回果野村的時候，發現比夏斯已經坐在果業村的村口等著他們了，臉上笑吟吟的。
只不過他身後是一圈圈被捆綁在一起的果野村居民，讓他的笑容滿是邪惡。
“呵呵呵，你們終於回來了！之前你們偷襲我，現在我也讓你們嚐嚐被偷家的滋味。”
比夏斯站起身來，笑呵呵的看著面前的小智三人。
身後的兩隻瑪狃拉和兩隻巨鉗螳螂一起圍住了被捆的果野村村民，讓小智他們投鼠忌器。
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小智握緊了拳頭，怒呵比夏斯，“比夏斯，快放開永久婆婆他們，否則別怪我不客氣！”
“皮卡皮卡！”皮卡丘跳在小智的前面，怒視前方，臉頰兩旁的電流閃爍。
“我們一定會讓你死無葬身之地！”
小霞和雪成都捏住了手中的精靈球，隨時準備攻擊。
“哈哈哈哈！”比夏斯仰天長笑，對小智他們的威脅不屑一顧。
“我看你們完全是搞不懂現在的狀況！”
“啪嗒！”比夏斯打了個響指。
身後的巨鉗螳螂直接拖著一位頭髮花白的老婆婆來到了前方。
“奶奶！！”後方的美久留著眼淚大叫道。
“快放開永久婆婆！”小智三人心中更為憤怒。
看到小智他們的樣子，比夏斯更為囂張，左手一把拉起昏迷的永久婆婆。
“呵呵呵，你們還挺在意這個老太婆嘛，那就更好了！”
“你！”比夏斯指著小智，殘忍的說道，“如果不想這個老太婆被我殺死，就趕快把你的所有精靈球丟過來。”
“還有你們，精靈球都給我丟過來！”比夏斯一一指過小霞和雪成。
小智他們不為所動，但隨著比夏斯將永久婆婆丟在地上，一隻腳踩著她的臉，力量逐漸加大，永久婆婆的身體已經扭曲了，臉上更是露出痛苦的表情。
小智他們被迫同意了。
“住手！”
“放開永久婆婆，我們把精靈球給你！”
小智說完，一把將自己的精靈球丟到比夏斯面前的空地之上，小霞和雪成也隨後把各自的精靈球丟出。
比夏斯笑容越發囂張，挑了挑眉毛道，“還有那只皮卡丘，把它給我抓住！”
“恰！”
“皮卡！”
一隻巨鉗螳螂瞬間跳到皮卡丘身邊，兩隻巨大的鉗子將皮卡丘束縛住，皮卡丘發出痛苦的呻吟。
“現在可以放開永久婆婆了嗎？”小智忍著怒火說道。
然而比夏斯怎麼可能答應小智他們的要求，他是壞人！
壞人的底線是沒有下限的，壞人說的話能相信嗎？
真是素質有待降低！
小智他們的精靈球都不在手上了，毫無戰鬥力，比夏斯現在可以說是為所欲為。
只見比夏斯殘忍一笑，對旁邊的另一只巨鉗螳螂招了招手，然後對著永久婆婆做了個手勢。
下一幕，小智他們，包括後面的美久和果野村的居民都愣住了。
“碰！”
一聲西瓜破開的聲音響起，鮮紅色的血液迸濺，永久婆婆連聲音都沒發出便被巨鉗螳螂一鉗子砸死。
“奶奶！”
“奶奶！！”
美久發出淒厲的喊叫聲，撕心裂肺的聲音震撼著所有人。
美久扭動著被繩子捆住的身體，掙扎著爬向永久婆婆身邊。
小智他們看到這一幕，目眥欲裂，所有的憤怒在這一刻全部爆發。
“啊！！”
“我要殺了你！”
小智不顧一切的衝向比夏斯，眼淚和鼻涕掛落在臉龐之上。
怎麼會！怎麼會！
上一刻還活生生存在的人，竟然直接被比夏斯殺掉了。
不可饒恕，不可饒恕！
然而小智赤手空拳，即使身體素質再好，也強不過精靈的身體，衝向比夏斯的小智直接被一旁守護的巨鉗螳螂踹飛。
然而小智沒有放棄，仍然向比夏斯衝去。
一邊衝鋒，小智手中一邊搓出一顆藍色的光球。
“波導彈！”
是了，小智不僅僅是人類，也是波導勇者！
“快快快，攔住他！”
比夏斯頓時大驚失色，連忙讓眾精靈擋在身前。
一隻瑪狃拉看著果野村的眾人，一隻巨鉗螳螂抓著皮卡丘。
另外的一隻巨鉗螳螂和瑪狃拉擋在小智身前，與憤怒無比的小智進行對抗。
波導彈與惡之波動對轟，大量的煙塵散佈，小智迅速衝向比夏斯，掩護小霞和雪成拿回精靈球。
小霞翻滾在地，撿到了暴鯉龍的精靈球，白光一閃，暴鯉龍出現在兩方中間。
“比夏斯，拿命來！暴鯉龍，使用破壞死光！”小霞怒斥。
“小丫頭片子，安敢如此！出來吧，班吉拉！”
比夏斯面目猙獰，手中的黑暗球往空中拋去，一隻眼神泛著紅光的班吉拉應聲出現。
“哈哈哈哈，讓你們見識見識黑暗班吉拉的力量吧！”
“吼！！”
這只班吉拉受到了黑暗球的影響，戰鬥力大幅度提高。
面對暴鯉龍的破壞死光，班吉拉巍然不懼，頂著攻擊衝到暴鯉龍身邊，一拳將暴鯉龍打倒。
“暴鯉龍！”小霞緊張的大喊道。
“火恐龍，使用噴射火焰！”
這時，雪成也拿回了自己的精靈球，讓夥伴火恐龍幫助暴鯉龍，一起對抗班吉拉。
但是黑暗班吉拉太過強大，光憑暴鯉龍和火恐龍完全打不過。
小霞又從地上撿起其他精靈球，將小智和她的精靈幾隻精靈一起放了出來。
“夥伴們，一起上吧！”
“吼！！”
“嗷嗚！！”
“——”
一聲聲咆哮響起，小智的噴火龍、妙蛙花、比雕等精靈全部出現，小霞的波克基斯和牛蛙君也一同出現，大量的精靈一起向班吉拉發起攻擊。
與此同時，比雕還衝向了鉗住巨鉗螳螂的皮卡丘，巨鉗螳螂被迫抵擋，皮卡丘迅速脫困。
小智也冷靜了下來，停止搓波導彈，與自家的一眾精靈站在一起。
“你們……都該死！”
比夏斯看著與自己對抗的小智三人，憤怒無比，不過心中多了些驚懼。
小智本身竟然會波導彈，這是他沒有想到的，而且小智和那個小丫頭的精靈還相當強力，他的黑暗班吉拉可能壓不住它們。
他有點想暫時“戰略轉移”了，反正雪拉比還沒有找到，不妨先退一步，之後再慢慢收拾他們。
小智這幾個小鬼頭都必須得死，還有那群果野村的居民，他都不會留下，全部幹掉。
等抓到了雪拉比，他再好好準備他的謀反大業，統治火箭隊，最後控制世界。
然而就在比夏斯想要退卻的時候，一隻綠色的精靈陡然出現在比夏斯和小智中間。
“雪拉比！”比夏斯目瞪口呆，隨後面露狂喜。
竟然是雪拉比，他一定要抓住它。
“班吉拉，快抓住雪拉比！”
“阻止它們！”
小智小霞看見雪拉比，頓時眼前一亮，但看到比夏斯有所動作，當即讓眾精靈保護雪拉比。
“哩！！！”
然而雪拉比突然輕吟一聲，空靈的聲音穿透整片森林，一陣陣綠色的熒光以雪拉比為中心向周圍擴散。
奇異的波動傳來，整片森林都在震盪。
就在大家心神震動的時候，一大群蟲系精靈從森林深處飛來，與之伴隨著的還有漫天飛舞的各種粉末。
“怎麼……不！”比夏斯鼻子嗅了嗅，突然面色大變，但話還沒有說全，大腦昏昏沉沉，整個身體變得麻木起來，一下便倒在地上。
不僅僅是比夏斯，還有他的幾隻精靈以及黑暗班吉拉都沒能躲過無數蟲系精靈的粉末攻擊，紛紛倒在地上。
小智他們看見比夏斯中招，一時大喜，然而還沒等他們高興起來，臉色都一齊變化。
“完了……我們也……中招了！”
“雪拉比……我們是……好……”
小智話還沒說完，整個人便癱在地上昏迷過去，小霞雪成，以及果野村的居民一同昏迷了。
之前暴躁而喧鬧的森林頓時失去了鬧事者，世界瞬間清淨了。
雪拉比圍繞著眾人飛了一圈，仔細觀察著每一個人。
當看到比夏斯的時候，雪拉比小巧可愛的面龐頓時憤怒了起來。
一道詭異的綠光從雪拉比的身體裡投入比夏斯的身體，比夏斯的身體肉眼可見的乾癟了下去，幾秒鐘後便直接化為一具乾屍，無數翠綠色的藤蔓將其包裹。
而對於小智等人，雪拉比並沒有做什麼，反而利用森林的職權，製造了一個藤床，將眾人都放了上去。
雪拉比從小智的身體裡發現了很多股特殊的氣息，有幾道氣息令它也內心恐懼。
這只雪拉比並不是這個時空的精靈，而是從四十年前穿越而來的時空穿梭者。
它並不認識比夏斯，但是比夏斯身上的氣息與其他人不同，這種邪惡力量的氛圍讓雪拉比的怒火直接對準了他，讓他成為了森林的肥料。
洩憤之後的雪拉比也逐漸冷靜，面對一地雞毛的果野村，它也有些不知所措。
突然，一股時空波動出現，另一只雪拉比從時空通道中鑽出，直接來到了同伴身邊。
“你不是這個時空的存在，你從哪裡來？”
“我來自過去，因為被人類追殺，我受傷了，意外逃到了這裡，藉助生命之湖，現在已經恢復了力量。”
另一只雪拉比心中瞭然，隨後指了指地上昏睡的眾人，問道，“他們是怎麼回事？”
“他們在爭鬥，裡面的壞人對我有想法，我把他解決了，剩下的人應該都沒有惡意。”雪拉比解釋道。
另一只雪拉比感受著眾人的氣息，並沒有懷疑自己同伴的話。
因為它感受到小智身上有鳳王和洛奇亞的氣息，這在傳說精靈眼中便像是擁有了通行證，所以不會傷害他。
後來的雪拉比不再管這些，反而對同伴告誡道，“這個時空要發生很恐怖的危機，你還是早點回去你的世界吧！這裡不屬於你！”
然而一開始出現的雪拉比卻搖搖頭，反駁道，“我們這一族本就可以在時空中一直穿梭，無論哪個時空對我們來說都沒有意義，為什麼有危險就讓我離開呢？”
“……”
“……穿梭在過去的很多同伴還並不知道這件事，我們可以將那些同伴先聚集起來，也為這個世界貢獻自己的一份力吧！”
“沒錯，如果這個時空受到創擊而崩潰，那個基於現在而存在的過去可能也會崩塌。”
“沒有未來的過去終將和未來一同逝去，沒有存在可以倖免。”
“所以將同伴們都找回來吧，我們也應該發揮出自己的作用，我寧願在現在中死亡，也不願意在過去崩逝……”
……
沉睡的小智等人並不知道，兩隻雪拉比在這裡討論了族群大事，等他們醒來的時候，果野村和這片森林又恢復了原來的樣子。
比夏斯消失了，之前的爭鬥彷彿沒有發生過一樣，一切都顯得極為平靜而安逸。
只有美久一個人跪在地上默默哭泣著，所有人都活了下來，甚至身上的傷痕都沒有了。
只有她的奶奶失去了蹤影，之前並不是夢，她的奶奶沒有了……
雪拉比只能治療，而不能復生，死了就是死了，它們也沒有辦法。
小智等人站在美久身邊，他們努力了，但還是有了悲劇發生。
他們不是神，只是普普通通的人……