民間傳說雙桂堂這兩棵桂樹是月宮中的嫦娥親手培養，嫦娥借觀音的淨瓶水為之澆灌，遣神燕去天河銜來肥泥為之壅土，用王母娘娘的雲剪為之修整，在嫦娥的精心護理下，這兩株桂樹枝繁葉茂，生機勃勃，在一個中秋之夜，嫦娥將它們送往人間。
這兩棵桂樹帶著滿枝的清香落在寧波天童寺院內。密雲法師將這兩棵桂樹交給弟子破山，讓他帶回蜀中，興建佛寺，傳播佛法，並稱桂樹生根之處就是你安身之地。
破山禪師尊師命，身背桂樹，跋涉了幾個月，進入蜀中。一日，他落腳在萬竹山。半夜裡，山間霞光四射，鐘鼓齊鳴，四周的村民聞聲而至，只見破山和尚正在打坐參禪，他所背兩株桂樹已落地生根，清香四溢。
從此，破山和尚就在雙桂落地之處建立禪院，並取名“雙桂堂”。桂樹至今尚存，枝繁葉茂，濃綠如雲。每年金秋時節，桂花滿枝，香飄數里，人們爭相觀賞。
破山禪師熟諳詩文，精於書畫，著有《雙桂草》、《破山語靈》等傳世，所留墨跡也為後人所珍藏。
他的詩，以幽默、詼諧見長。如他的《自贊詩》寫道：“這個川老蜀，渾無奇特處。問禪禪不知，問教教非熟。懶散三十年，人天忽推出。握條短杖藜，打佛兼打祖。”
他的弟子很多，遍及四川、雲南、貴州等省，有的還去東南亞弘法。因此，雙桂堂在東南亞地區也有一定的影響。
雙桂堂建立以後，得到清朝歷代皇帝的支援，連續不斷地修建了二百多年，從公元一六五三至一九二六年，雙桂堂歷經破山、竹禪等七代祖師累世修建七殿、八堂、八院，佔地面積一百二十畝（該寺最後一次修整是一九八零年）。
民國時期，雙桂堂以它宏傳的規模、莊嚴的殿堂、豐富的藏經、獨特的雕塑被列為“蜀中叢林之首”。
雙桂堂初創之時，正是反清復明高潮之際，盤踞在川東、陝南和鄂西的蔓東十三家利用易守難攻的有利地形，採取松散型聯合，流動作戰的戰術，打著明朝的旗號，共同抗擊清兵，鎮守著大西南的門戶。貧東十三家據險自守，長期與清廷對峙，成為清朝掃平西南諸省和一統天下的障礙。
破山奔走於反清復明陣營之間，以一個佛門中有地位、社會上有影響的高僧的身份，鼓勵抗清將領們堅持鬥爭，復興明朝。抗清將領們也成為破山建立雙掛堂的資助者和保護傘，使雙掛堂得以迅速竣工，佛事活動得以正常開展。
最終打破這一僵持局面，消滅反清武裝勢力，為清朝完成統一大業的是順治十四年出任川陝三邊總督的清朝重臣李國英。
而李國英在完成這項重大任務的前前後後，均注重建立和發展與雙掛堂破山的關係。李國英透過書信或委派專人到雙桂堂，對破山表示崇敬和景仰，並說自己對佛教如何的信仰，對佛門如何的親近，希望有朝一日大師能發慈悲，來教育自己。
李國英不愧為清朝政府一位有膽識有謀略有德行的封疆大吏，他很快得到了破山的好感，使之成為盟友。
但是，破山的這種變化，其深層次的原因就是現實的需要。反清復明運動已持續二十年，戰火的侵擾使巴山蜀水成為白骨露於野，千里無雞鳴的悲慘世界。
出沒於川東地區的黎東十三家和出沒於滇黔地區的永曆政權的其他武裝勢力，雖然均以反清復明為旗號，但實際上不過是佔山為王，紀律鬆散，各自為陣，胸無大志的散兵遊勇，在清朝大兵壓境之際扼險自保，也只是作垂死的掙扎罷了，況且他們中間，燒殺成性的有之，為利忘義的有之，腐化墮落的有之，投降變節的也有之！
他們自身的腐敗和內部的傾軋足以使其人和鬥志喪失殆盡，由這些人來擔當反清復明的民族大任，其成功的把握是可想而知的。即使僥倖獲得成功，除了禍國殃民，他們還會有什麼能耐？從弘光政權、隆武政權到魯王政權，一個個短命的南明王朝其腐朽早已大白於天下，路人皆知。
而永曆政權雖以廣闊的西南為根據地，堅持時間最久，生命力最強，但其中激烈的黨爭，不斷的內認亦昭然若揭。
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日落西山，氣息奄奄的氣象預示著它的壽終正寢之日也行將不遠了。進出雙掛堂的遊僧信徒們頻繁來往於西南各地，種種資訊的綜合，使破山越來越感到反清復明不過是一場無法實現的夢，相反，持續的戰亂則只能增加人民的痛苦和社會的災難。
久亂思治，祈求和平成為破山晚年的強烈願望。由此，他逐漸由一個純粹的民族主義者轉變成了一個積極的民生主義者，他以關懷、慈愛、保護人民為己任，在給李國英的詩中有重開巴國蘇民困，再造黎門啟世賢人壽同天壽，民安即國安的詩句，就是表明態度，希望他治理好這片土地，安民蘇困，不要再當殺手。
清朝多年末能解決的西南歸屬問題在李國英手裡終於劃上了句號，而李國英所施行的也正是他所謂的仁政。安居雙桂堂的破山，受到各階層人士的頂禮膜拜。
破山總是給他們講解佛法，敘說因果報應，以不殺為至德。所以，從朝廷重臣到總督巡撫按、縣官吏，前往朝拜雙桂堂者不計其數。其中，明朝叛將吳三桂引清兵入關後，被封為平西王，駐節陝西漢中，為了建立與破山的關係，又害怕遭到大師的拒絕，便以夫人的名義派遣專人千里迢迢來到雙桂堂，贈送了最高檔最豪華的整套佛門用品。這顯然是吳三枝為平定西南拉攏破山所作的政治鋪墊。
以後，吳三桂到了雲南，想不到他的夫人—名揚天下的蘇州名妓陳圓圓突然以削髮出家作為自己的最終歸宿，改名為寂靜，字玉庵。一代名妓陳圓圓著破紅塵，大概與雙桂堂中的破山不無聯絡吧！
雙桂堂在中國明清之際發揮了不容忽視的重要歷史作用，特別是當重慶已變為清朝李國英的總督府後，長壽、墊江等縣也盡人清朝的版圖，而以梁平為界，川東三峽地區則是抗清武裝的勢力範圍。雙掛堂成了雙邊頻繁往來的據點，破山成了聯絡雙邊關系的紐帶，對儘快結束戰亂，推動歷史發展的程序產生了積極的作用。
據說，貝葉經失竊後，梁平當地傳出了一些“奇怪”的事：原本配成對的金桂銀桂樹，金桂樹一夜間凋零枯死，雙桂堂附近成群的白鷺飛往他鄉。針對這些“傳說”，重慶晨報記者在當地展開走訪調查。
當地還有傳言說，國寶貝葉經被盜後，銀桂開的花竟然發生了變化，本來只開白花的銀桂樹，每年秋天就變成一半開黃花、一半開白花，且沒有原先那樣繁茂。而據雙桂堂的僧人介紹，這裡的銀桂樹，本來開花就是白中帶黃，一直如此。
還有傳言說，貝葉經失竊後，當地上百隻白鷺成群地遠飛他鄉。而我們瞭解的是，當地逢辦紅白喜事時，都要燃放鞭炮。有村民透露，其實白鷺飛走，與越來越多的人燃放鞭炮有很大關係。釋身志大師說，這三個傳言，都被外界過度誇張、玄化了，其實都是一些普通的自然現象。
實際上這個“貝葉經”大盜不是第一次犯案了，而且這一次盜搶“貝葉經”也是非同一般的，要知道被其致死的釋身忠乃是雙桂堂第一武功高手，一套羅漢拳練得出神入化罕逢敵手，再加上一身橫練的鐵布衫金鐘罩功夫，一般常人十四五人都不是他的對手，反而被這位蔡忠義輕易地殺害有點不通情理，百思不得其解。